Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC46A2Q9BY10 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms