Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC39.14■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
FANCD2Q9BXW9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC39.07■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
FANCD2Q9BXW9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
FANCD2Q9BXW9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
FANCD2Q9BXW9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
FANCD2Q9BXW9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
FANCD2Q9BXW9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
FANCD2Q9BXW9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
FANCD2Q9BXW9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
FANCD2Q9BXW9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
FANCD2Q9BXW9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
FANCD2Q9BXW9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
FANCD2Q9BXW9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
FANCD2Q9BXW9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
FANCD2Q9BXW9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
FANCD2Q9BXW9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
FANCD2Q9BXW9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
FANCD2Q9BXW9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
FANCD2Q9BXW9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms