Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms