Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL25A1Q9BXS0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL25A1Q9BXS0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL25A1Q9BXS0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms