Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1QTNF3Q9BXJ4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QTNF3Q9BXJ4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms