Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1QTNF4Q9BXJ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF4Q9BXJ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms