Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOL6Q9BWW8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 498 ms