Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW7

SCRT1, Transcriptional repressor scratch 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT1Q9BWW7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCRT1Q9BWW7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.5 ms