Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP1Q9BWH6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms