Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HIRIP3Q9BW71 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms