Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MKNK1Q9BUB5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKNK1Q9BUB5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKNK1Q9BUB5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MKNK1Q9BUB5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MKNK1Q9BUB5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MKNK1Q9BUB5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MKNK1Q9BUB5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MKNK1Q9BUB5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKNK1Q9BUB5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms