Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms