Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms