Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYT17Q9BSW7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYT17Q9BSW7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYT17Q9BSW7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SYT17Q9BSW7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYT17Q9BSW7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYT17Q9BSW7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYT17Q9BSW7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT17Q9BSW7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT17Q9BSW7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms