Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM56Q9BRZ2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms