Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LARP6Q9BRS8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP6Q9BRS8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms