Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK0

REEP2, Receptor expression-enhancing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP2Q9BRK0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP2Q9BRK0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REEP2Q9BRK0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms