Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
CPPED1Q9BRF8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CPPED1Q9BRF8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms