Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF4Q9BQW3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EBF4Q9BQW3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EBF4Q9BQW3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms