Protein–RNA interactions for Protein: Q99626

CDX2, Homeobox protein CDX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDX2Q99626 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDX2Q99626 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDX2Q99626 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms