Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP88Q99567 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP88Q99567 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP88Q99567 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms