Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EYA3Q99504 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EYA3Q99504 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.57■■■□□ 2
EYA3Q99504 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EYA3Q99504 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EYA3Q99504 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms