Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP2Q96SN8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms