Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.9 ms