Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LMTK3Q96Q04 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
LMTK3Q96Q04 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LMTK3Q96Q04 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms