Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP3Q96P20 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP3Q96P20 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms