Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF354BQ96LW1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms