Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDLIM2Q96JY6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDLIM2Q96JY6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDLIM2Q96JY6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms