Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DCHS1Q96JQ0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCHS1Q96JQ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms