Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC136Q96JN2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms