Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRIQ1Q96JM4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
LRRIQ1Q96JM4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
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