Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
COG3Q96JB2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
COG3Q96JB2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms