Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFRP2Q96HF1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFRP2Q96HF1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms