Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APIPQ96GX9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APIPQ96GX9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms