Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCD1Q96GM5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCD1Q96GM5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCD1Q96GM5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms