Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX11Q96FC9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX11Q96FC9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms