Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNFT2Q96EX2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNFT2Q96EX2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms