Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TVP23CQ96ET8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms