Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGF29Q96ES7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms