Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms