Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC126Q96EE4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms