Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms