Protein–RNA interactions for Protein: Q96DE9

CXorf40B, Protein CXorf40B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40BQ96DE9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXorf40BQ96DE9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXorf40BQ96DE9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms