Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC39Q96DD0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC39Q96DD0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms