Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTUB2Q96DC9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms