Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF653Q96CK0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms