Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VOPP1Q96AW1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VOPP1Q96AW1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms