Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC17Q96AE7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC17Q96AE7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms