Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms