Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP13Q92995 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP13Q92995 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP13Q92995 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP13Q92995 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP13Q92995 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP13Q92995 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP13Q92995 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP13Q92995 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP13Q92995 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP13Q92995 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP13Q92995 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP13Q92995 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP13Q92995 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP13Q92995 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP13Q92995 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP13Q92995 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP13Q92995 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP13Q92995 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP13Q92995 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP13Q92995 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP13Q92995 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP13Q92995 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP13Q92995 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP13Q92995 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP13Q92995 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP13Q92995 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP13Q92995 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP13Q92995 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP13Q92995 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP13Q92995 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP13Q92995 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP13Q92995 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP13Q92995 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP13Q92995 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP13Q92995 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP13Q92995 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP13Q92995 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP13Q92995 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP13Q92995 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP13Q92995 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP13Q92995 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP13Q92995 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP13Q92995 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP13Q92995 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP13Q92995 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP13Q92995 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP13Q92995 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP13Q92995 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP13Q92995 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP13Q92995 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP13Q92995 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP13Q92995 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP13Q92995 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP13Q92995 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP13Q92995 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP13Q92995 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP13Q92995 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP13Q92995 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP13Q92995 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP13Q92995 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP13Q92995 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP13Q92995 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP13Q92995 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP13Q92995 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP13Q92995 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP13Q92995 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP13Q92995 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP13Q92995 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP13Q92995 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP13Q92995 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP13Q92995 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP13Q92995 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP13Q92995 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP13Q92995 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP13Q92995 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP13Q92995 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP13Q92995 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP13Q92995 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP13Q92995 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP13Q92995 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP13Q92995 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP13Q92995 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP13Q92995 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP13Q92995 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP13Q92995 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP13Q92995 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP13Q92995 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP13Q92995 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP13Q92995 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP13Q92995 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP13Q92995 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP13Q92995 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP13Q92995 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP13Q92995 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP13Q92995 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP13Q92995 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP13Q92995 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP13Q92995 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP13Q92995 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms